L'année 2006 a été marquée par de nouveaux troubles provoqués à Kidal au mois de mai par d'anciens combattants de la rébellion touarègue des années 90 qui ont attaqué la base militaire et réalimenté l'insécurité dans la région. Ces événements ont eu des répercussions jusqu'à Tessalit (endroit où se déroule le projet) et ont causé un certain retard dans l'exécution de certaines des activités de développement : de nombreux maraîchers n'ont pas cultivé leur parcelle cette année, incertains de pouvoir rester à Tessalit en cas de développement du conflit et certaines missions ont été reportées.
Toutefois, grâce aux différents aménagements réalisés les années précédentes et à la consolidation des techniques maraîchères en ville et en brousse, l'année 2006 a été synonyme d'abondantes récoltes dans la plupart des jardins de Tessalit et d'un système oasien se montrant de plus en plus performant et durable.
Près de 300 arbres fruitiers ont également été plantés dans les jardins de Tessalit (100 manguiers greffés, 100 orangers, 50 mandariniers, 50 pamplemoussiers) ainsi que 200 plants de dattiers in vitro importés de France et acclimatés préalablement par l'association Zankaï Aljana (voir autre partenaire du Mali).